Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec1P51908 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms