Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms