Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfP51642 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfP51642 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfP51642 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfP51642 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfP51642 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfP51642 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CntfP51642 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CntfP51642 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CntfP51642 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CntfP51642 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CntfP51642 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfP51642 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfP51642 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfP51642 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfP51642 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfP51642 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfP51642 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfP51642 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfP51642 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms