Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbrP50284 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LtbrP50284 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms