Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc13P50207 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms