Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpcP49452 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CenpcP49452 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CenpcP49452 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CenpcP49452 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CenpcP49452 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CenpcP49452 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CenpcP49452 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CenpcP49452 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CenpcP49452 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms