Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod6P48986 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Neurod6P48986 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms