Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VdrP48281 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VdrP48281 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VdrP48281 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VdrP48281 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VdrP48281 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VdrP48281 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VdrP48281 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VdrP48281 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VdrP48281 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VdrP48281 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VdrP48281 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VdrP48281 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VdrP48281 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VdrP48281 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VdrP48281 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VdrP48281 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms