Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PfkmP47857 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PfkmP47857 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PfkmP47857 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PfkmP47857 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PfkmP47857 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms