Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgavP43406 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgavP43406 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms