Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec3bP43025 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec3bP43025 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms