Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LifrP42703 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LifrP42703 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LifrP42703 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LifrP42703 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LifrP42703 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LifrP42703 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LifrP42703 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LifrP42703 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LifrP42703 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LifrP42703 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LifrP42703 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LifrP42703 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LifrP42703 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LifrP42703 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LifrP42703 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LifrP42703 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LifrP42703 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LifrP42703 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LifrP42703 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LifrP42703 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LifrP42703 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LifrP42703 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LifrP42703 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LifrP42703 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LifrP42703 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LifrP42703 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LifrP42703 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LifrP42703 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LifrP42703 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LifrP42703 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LifrP42703 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LifrP42703 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LifrP42703 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LifrP42703 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LifrP42703 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LifrP42703 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms