Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LtbP41155 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LtbP41155 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LtbP41155 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LtbP41155 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LtbP41155 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LtbP41155 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LtbP41155 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms