Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cap1P40124 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cap1P40124 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cap1P40124 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cap1P40124 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cap1P40124 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms