Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp3P39876 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timp3P39876 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Timp3P39876 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms