Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TtlP38585 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtlP38585 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtlP38585 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtlP38585 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtlP38585 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtlP38585 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TtlP38585 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TtlP38585 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtlP38585 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TtlP38585 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtlP38585 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtlP38585 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtlP38585 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtlP38585 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TtlP38585 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TtlP38585 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TtlP38585 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms