Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Grin2aP35436 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2aP35436 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2aP35436 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms