Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SsbP32067 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SsbP32067 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SsbP32067 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SsbP32067 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SsbP32067 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SsbP32067 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SsbP32067 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SsbP32067 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SsbP32067 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SsbP32067 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SsbP32067 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SsbP32067 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SsbP32067 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SsbP32067 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SsbP32067 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SsbP32067 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SsbP32067 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SsbP32067 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SsbP32067 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SsbP32067 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SsbP32067 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SsbP32067 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SsbP32067 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SsbP32067 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SsbP32067 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SsbP32067 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms