Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsx2P31316 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms