Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd1P30999 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms