Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp3P28862 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mmp3P28862 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp3P28862 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp3P28862 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp3P28862 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mmp3P28862 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp3P28862 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp3P28862 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp3P28862 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp3P28862 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms