Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IppP28575 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IppP28575 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IppP28575 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IppP28575 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IppP28575 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IppP28575 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IppP28575 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IppP28575 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IppP28575 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IppP28575 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IppP28575 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IppP28575 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IppP28575 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IppP28575 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms