Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfraP26618 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfraP26618 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms