Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af2P26369 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af2P26369 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af2P26369 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms