Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgaP26339 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgaP26339 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.2 ms