Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd247P24161 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd247P24161 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms