Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd12P23812 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd12P23812 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms