Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clk1P22518 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clk1P22518 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms