Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tap1P21958 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms