Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc2P20801 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnnc2P20801 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms