Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb9P20615 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb9P20615 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms