Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ms4a2P20490 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms