Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trap1aP19473 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trap1aP19473 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trap1aP19473 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trap1aP19473 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trap1aP19473 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trap1aP19473 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms