Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc1P19123 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms