Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RargP18911 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RargP18911 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RargP18911 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RargP18911 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RargP18911 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RargP18911 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RargP18911 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RargP18911 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RargP18911 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RargP18911 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RargP18911 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RargP18911 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RargP18911 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RargP18911 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RargP18911 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RargP18911 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RargP18911 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms