Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rps6ka1P18653 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms