Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna1P16388 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna1P16388 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms