Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rag1P15919 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rag1P15919 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms