Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme1P15532 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 749.3 ms