Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PolP11369 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PolP11369 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolP11369 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolP11369 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolP11369 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolP11369 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolP11369 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolP11369 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolP11369 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolP11369 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolP11369 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolP11369 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolP11369 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolP11369 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms