Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd8bP10300 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd8bP10300 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms