Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms