Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Igsf6P0C6B7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281 ms