Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd3P09027 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms