Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NeflP08551 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NeflP08551 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NeflP08551 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NeflP08551 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NeflP08551 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeflP08551 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NeflP08551 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NeflP08551 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NeflP08551 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NeflP08551 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NeflP08551 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NeflP08551 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeflP08551 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeflP08551 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeflP08551 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeflP08551 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeflP08551 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeflP08551 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeflP08551 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeflP08551 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeflP08551 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeflP08551 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeflP08551 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeflP08551 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NeflP08551 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NeflP08551 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NeflP08551 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeflP08551 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeflP08551 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeflP08551 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeflP08551 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeflP08551 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeflP08551 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeflP08551 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeflP08551 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeflP08551 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeflP08551 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeflP08551 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeflP08551 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms