Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna4P07351 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna4P07351 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms