Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf1P07141 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms