Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TnfP06804 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnfP06804 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnfP06804 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnfP06804 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnfP06804 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnfP06804 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnfP06804 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnfP06804 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnfP06804 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnfP06804 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TnfP06804 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TnfP06804 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TnfP06804 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TnfP06804 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms