Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Me1P06801 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Me1P06801 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Me1P06801 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Me1P06801 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Me1P06801 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Me1P06801 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Me1P06801 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Me1P06801 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Me1P06801 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Me1P06801 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Me1P06801 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Me1P06801 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Me1P06801 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Me1P06801 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Me1P06801 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms