Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgamP05555 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgamP05555 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms